А что они должны были дать? Посмотреть их можно?Логи ошибок error_log и медленных запросов mysql-slow.log ничего не дали
Версия mysql какая?У меня остается только один вариант. Это старая версия php и InstantCMS.
PHP 5.3. InstantCMS 1.10.3
Причем тут php, если проблема явно в mysql? Настраивать mysql надо.Если я подниму версию php хотя бы до 5.6, это ударит коду сайта?
Вот почитайте:
habr.com/ru/post/108418/