Как правильно подключить файлы настройки NGINX?

Имеется контрольная панель Hestia в конфигурации NGINX+php-fpm
В панели создан пользователь site для адреса site.name
Соответственно автоматически сгенерирован файл конфигурации NGINX:
/home/site/conf/web/site.name/nginx.conf
в шапке этого файла следующее:
#=======================================================================#
# Default Web Domain Template                                                                                                      #
# DO NOT MODIFY THIS FILE! CHANGES WILL BE LOST WHEN REBUILDING DOMAINS     #
#=======================================================================#
То есть менять не рекомендуют.
Содержимое файла:

server {
    listen      XX.XXX.XXX.XXX:80;
    server_name site.name www.site.name;
    root        /home/site/web/site.name/public_html;
    index       index.php index.html index.htm;
    access_log  /var/log/nginx/domains/site.name.log combined;
    access_log  /var/log/nginx/domains/site.name.bytes bytes;
    error_log   /var/log/nginx/domains/site.name.error.log error;
 
    include /home/site/conf/web/site.name/nginx.forcessl.conf*;
 
    location / {
 
        location ~* ^.+\.(jpeg|jpg|png|webp|gif|bmp|ico|svg|css|js)$ {
            expires     max;
            fastcgi_hide_header "Set-Cookie";
        }
 
        location ~ [^/]\.php(/|$) {
            fastcgi_param SCRIPT_FILENAME $document_root$fastcgi_script_name;
            if (!-f $document_root$fastcgi_script_name) {
                return  404;
            }
 
            fastcgi_pass    unix:/run/php/php7.4-fpm-site.name.sock;
            fastcgi_index   index.php;
            include         /etc/nginx/fastcgi_params;
            include     /home/site/conf/web/site.name/nginx.fastcgi_cache.conf*;
        }
    }
 
    location /error/ {
 alias   /home/site/web/site.name/document_errors/;
    }
 
    location ~ /\.(?!well-known\/) {
       deny all;
       return 404;
    }
 
    location /vstats/ {
        alias   /home/site/web/site.name/stats/;
        include /home/site/web/site.name/stats/auth.conf*;
    }
 
    include     /etc/nginx/conf.d/phpmyadmin.inc*;
    include     /etc/nginx/conf.d/phppgadmin.inc*;
    include     /home/site/conf/web/site.name/nginx.conf_*;
}
 

В теле файла есть ссылки на подключаемые файлы конфигурации:

include   /home/site/conf/web/site.name/nginx.forcessl.conf*;
include   /etc/nginx/fastcgi_params;
include   /home/site/conf/web/site.name/nginx.fastcgi_cache.conf*;
include   /home/site/web/site.name/stats/auth.conf*;
include   /etc/nginx/conf.d/phpmyadmin.inc*;
include   /etc/nginx/conf.d/phppgadmin.inc*;
include   /home/site/conf/web/site.name/nginx.conf_*;

Вопрос: 
1. Как полностью заменить файл конфигурации на свой? Если я в файл  /home/site/conf/web/site.name/nginx.conf_instant1 включу полностью другую конфигурацию, например изhttps://instantcms.ru/forum/nginx-php-fpm-for-instantcms-v2-x.html — будет ли файл по умолчанию проигнорирован, а подключится только эта конфигурация?
2. Или надо подключить к дефолтному файлу только желаемые блоки? 

instantcms.ru/forum/i-vnov-pro-config-nginx-php-fpm.html#post-326806

instantcms.ru/forum/i-vnov-pro-config-nginx-php-fpm.html#post-326806

Спасибо. Извиняюсь за нубство. Только начинаю разбираться. Мне не понятно следующее. Вот у меня панель создала дефолтный файл, который изменять не рекомендует, так как изменения будут утеряны.

Предположим  в дефолтном и подключаемом по include файле встречаются однотипные секции, но с разными параметрами. Какому параметру будет отдано предпочтение?

 NET, 

Новый шаблон создайте.

С помощью @IamB сделали вполне работоспособный шаблон, который работает на моём сайте с апреля:
instantcms.ru/users/files/download7685.html
Два файла (один для SSL, другой для без него) положить в папку /usr/local/vesta/data/templates/web/nginx/php-fpm/
После этого просто выбрать шаблон в настройках сайта: